In der Saison 2009/2010 gibt es ein anderes Welt Cup System als in den vorangegangenen Saisons. Gemäß ISU Communication 1558 besteht die wesentliche Änderung darin, dass sich nicht mehr alle Sportler auf zwei Strecken am gleichen Tag verteilen (vgl.: Welt Cup System seit 2006), sondern jedes Land seine besten Läufer auf jeder Strecke einsetzen darf. Dadurch ist die Konkurrenz auf jeder Distanz dichter und folglich das Niveau höher. Vermutlich wurde die Änderung für die laufende Saison durchgeführt, um jeder Nation die Chance zu geben, seine besten Sportler auf jeder Strecke einzusetzen, um die bestmöglichen Olympiaqualifikationschancen auszuschöpfen. Eine weitere Besonderheit des neuen Systems ist die Verteilung aller Strecken und Runden auf 4 Tage. Dabei ist der Welt Cup wieder in Qualifikationsrunden und Welt-Cup-Runden eingeteilt. Die Einzelstrecken-Qualifikationsrunden finden immer donnerstags und freitags statt, die Staffel-Vorrunden zusätzlich am Freitag. Alle Finals werden dann am Wochenende ausgetragen.

Über 1500m und 500m am Donnerstag sowie über 1000m am Freitag werden nur die Vorrunden bis einschließlich zum Achtelfinale stattfinden. Am Samstag beginnen die Besten über 1500m und 500m mit dem Viertelfinale und suchen nach dem Halbfinale ihre Sieger im A- und B-Finale. Auch am Sonntag müssen noch die besten 16 1000m-Läufer im Viertel-, Halb- und Finale um den Sieg ringen. Die Staffelwettbewerbe teilen sich nur auf Freitag und Sonntag auf. Freitags laufen die Damen und Herren ihre Viertel- und (bei mehr als 16 Staffelteams) eventuell auch Achtelfinals. Am Sonntag finden dann zum Abschluss des Welt-Cup-Wochenendes die Staffel-Halbfinals und Finals der Damen und Herren statt. Für die Staffeln sind also zwei Läufe direkt hintereinander angesetzt, das Achtel- und Viertelfinale sowie das Halb- und Finale.

Eine Gesamtwertung, welche die Resultate der Sportler jeder einzelnen Strecke addiert, gibt es wieder nicht. Somit gibt es bei allen Welt Cups nur Einzelstrecken-Wertungen.

Jede Nation darf max. 6 Damen und 6 Herren zum Welt Cup anmelden. Das besondere ist jedoch, dass immer nur 3 der 6 Läufer auf den Einzelstrecken laufen dürfen. Dabei können aber auf der einen Strecke andere Sportler eingesetzt werden, als auf der anderen. Es kann also sein, dass jeder Sportler am Wochenende zum Einsatz kommt (Einzel und/oder Staffel), oder ungünstigsten Falls nur die 3 gleichen Sportler die 3 Einzelstrecken besetzen und ein vierter Läufer die Staffel komplettiert. Somit wäre es möglich, dass ein oder zwei Sportler das gesamte Wochenende nur als Ersatzmänner beim Warm Up aufs Eis dürfen.

ISU Communication #1558 - "World Cup Short Track Speed Skating 2009/2010"